Description :
Plusieurs modules thématiques seront proposés aux étudiants qui devront en choisir 3 en fonction de leur projet professionnel et sujet de stage. Chaque module consistera en une séquence pédagogique de 33,3h proposée par une équipe pédagogique constituée de personnels permanents et/ou de vacataires de structures extérieures (par exemple, un module de botanique pourrait être proposé par des intervenants du conservatoire botanique national de Franche-Comté) et visant au renforcement des compétences méthodologiques et/ou taxonomiques dans un domaine donné (Cf objectifs pédagogiques ci-dessous). Il s’agira de mise en situation réelle à travers la proposition de projets concrets nécessitant l’acquisition et le traitement de données environnementales. L’équipe pédagogique cherchera à croiser les compétences des différents modules thématiques en proposant des projets transversaux.
Les modules thématiques suivants (liste non exhaustive) seront proposés.
- De la donnée scientifique à la décision publique
- Eco-épidémiologie
- Ecotoxicologie
- Méthodes d’étude des réseaux trophiques
- Gestion et suivi des écosystèmes
- Ecologie moléculaire
- Paléo-écologie
- Modélisation statistique, analyse spatiale et paysagère
- Spécialisation taxonomique
Les acquis d’apprentissage sont donc spécifiques à chaque module et sont par conséquent déclinés par option.
Objectifs pédagogiques :
De la donnée scientifique à la décision publique :
Connaissances :
• Identifier les acteurs impliqués et leurs rôles (alerte, évaluation, décision, gestion des risques, contrôle…).
• Comprendre les jeux d’acteurs et connaître les processus de décision en matière de risques alimentaires et environnementaux.
• Identifier des questions scientifiques « pendantes ».
Savoir-faire :
• Analyser les processus de décision et enjeux des mesures de gestion du risque, ainsi que la place de la sciences et des scientifiques dans ces processus.
• Développer un esprit critique (connaissance avérée/intox, information/désinformation, opacité/transparence…) et une ouverture d’esprit.
• Mettre en pratique différentes méthodes (i) de caractérisation des dangers des substances chimiques (contaminants, phytosanitaires, biocides…), (ii) d’évaluation de l’exposition du consommateur, et (iii) d’évaluation des risques sanitaires et environnementaux liés à l’alimentation.
Responsable du module : Pierre-Marie BADOT, pierre-marie.badot@univ-fcomte.fr
Éco-épidémiologie :
Savoir-faire :
• Cadrer les questions de santé publique dans une approche systémique.
• Mettre au point des protocoles de recherche pluridisciplinaire à des échelles pertinentes afin d’étudier les systèmes ciblés.
Responsable du module : Frédéric MAUNY, frederic.mauny@univ-fcomte.fr
Écotoxicologie :
Connaissances :
• Maîtrise des concepts théoriques (bioaccumulation, réponses à différents niveaux d’organisation biologique…) et appliqués (évaluation du risque, biosurveillance) de l’écotoxicologie.
Savoir-faire :
• Mettre en place des techniques de terrain (échantillonnage de sol, suivi biologique) et de laboratoire (conditionnement de sol et de tissus, analyses de polluants, bioessais de toxicité).
• Mettre en oeuvre une approche écotoxicologique basée sur des méthodes de laboratoire et de terrain afin d’orienter les questions de recherche et de gestion.
Responsable du module : Michael COEURDASSIER, michael.coeurdassier@univ-fcomte.fr
Méthodes d’étude des réseaux trophiques :
Connaissances :
• Connaître les concepts et outils clés de l’étude des réseaux trophiques et l’évaluation des interactions trophiques.
Savoir-faire :
• Acquérir les techniques d’échantillonnage d’un lac (prélèvement benthique par carottage, benne Ekman, filet à plancton…).
• Maîtriser les méthodes de conditionnement des échantillons.
• Analyser et interpréter des résultats : signature isotopique, taux de carbone, rapport C:N …
Responsable du module : Hélène MASCLAUX, helene.masclaux@univ-fcomte.fr
Gestion et suivi des Ecosystèmes :
Connaissances :
• Connaître les approches et méthodes actuelles et émergentes de gestion adaptative des espaces protégés (plans de gestion de réserve naturelle, Open Standards for the Practice of Conservation…).
• Connaître les concepts et outils de suivi de la biodiversité (adaptive monitoring, méthodes de suivi classiques et moins invasives…).
Savoir-faire :
• Avoir un regard critique sur es concepts et outils de la gestion des espaces et du suivi des espèces.
Responsable du module : Renaud SCHEIFLER, renaud.scheifler@univ-fcomte.fr
Ecologie moléculaire :
Connaissances :
• Connaître les outils moléculaires disponibles pour résoudre des problématiques écologiques.
Savoir-faire :
• Appliquer des méthodes élémentaires d’analyse de l’ADN : extraction et amplification d’ADN, électrophorèse.
• Manipuler des données issues d’analyses moléculaires (séquences d’ADN, profils génétiques).
Responsable du module : Eve AFONSO, eve.afonso@univ-fcomte.fr
Paléo-écologie :
Savoir-faire :
• Appliquer des méthodes de terrain en paléo-écologie (carottage, échantillonnage, datation, scannage/étude systématique de carottes…).
• Mettre en place une approche paléo-écologique afin d’orienter des enjeux et questions de recerches et de gestion.
Responsable du module : Laurent MILLET, laurent.millet@univ-fcomte.fr
Modélisation statistique, analyse spatiale et paysagère :
Savoir-faire :
• Approfondir sa maîtrise des logiciels d’analyses statistiques (R, R Studio) ainsi que de SIG (QuantumGIS), et de la simulation multi-agents.
• Être autonome dans le traitement des données spatialisées.
Responsable du module : Patrick GIRAUDOUX, patrick.giraudoux@univ-fcomte.fr
Spécialisation taxonomique :
Connaissances :
• Connaître la taxonomie, la biologie, l’écologie et les méthodes d’inventaire de groupe(s) taxonomique(s) choisi(s) en lien avec son projet professionnel.
Savoir-faire :
• Développer des compétences dans l’identification et l’inventaire de taxon(s) de la faune et/ou de la flore.
• Collaborer avec des acteurs du tissu socio-économique dans le cadre de l’acquisition de ces compétences.
• Identifier ses lacunes pour optimiser l’apprentissage universitaire et extra universitaire (activités associatives…) pour acquérir un niveau de compétence professionnel.
Responsable du module : Renaud SCHEIFLER, renaud.scheifler@univ-fcomte.fr
Les pré-requis et ressources bibliographiques sont dépendants de l’option concernée. Toutefois, le choix des options étant basé sur les intérêts personnels, le projet professionnel et le sujet de stage de chaque étudiant, les pré-requis sont implicitement en accord avec le profil de l’étudiant.
Mode d’évaluation :
Rapport écrit et/ou soutenance orale (selon les modules thématiques).
Responsables :
Michael COEURDASSIER, michael.coeurdassier@univ-fcomte.fr
Hélène MASCLAUX, helene.masclaux@univ-fcomte.fr
Laurent MILLET, laurent.millet@univ-fcomte.fr